1） 检验申请模块：实现电子申请检验单的开单、撤销、查询、字典设置等。检验申请单所关联的信息应有门诊、住院号码，检验项目，标本类型，检验组别，入院初始诊断，以及病人的一些其他信息等。
 
2） 标本采集模块：实现条形码打印（打印条码模式）、扫描对照（预条码模式）、采集提示、标本交接单生成等，可随时查询采样计划、打印采样任务表，记录采样者、采样日期、采样时间、样本描述等。另外应该有病人回执单，以便最终能实现患者凭借条形码回执单信息自主打印报告，最终能起到保护病人隐私不被泄露。
 
3）标本接收：可与HIS系统连网，从HIS中获取病人信息及检验项目，核对样本是否收费。收到标本可以自动打印清单，记录拒收样本理由并通知申请者。实现标本按组别的分类接收，以提高检验速度。
 
4）集中处理模块：实现信息录入、结果修改、调整、标本合并、手工结果、报告打印、结果审核、各类相关查询统计、图形、报表等。
 
5）设备联机及驱动模块：实现自动将数据送入网络，并进行模式识别，判断为何种资料。质控、定标及检验结果能够自动分离，检测结果经审核无误后，记录方才可被提交到主数据库。计算导出的项目，计算公式可由用户设置并自动计算。通过内部网络联接院所有的检验设备，并可将检验结果发送到每个临床(门诊、住院)医生工作站。
 
6）报告审核模块：实现单个或批量报告审核，能自动进行当前数据与历史数据比较，并用图形显示。根据不同年龄性别自动调用不同的参考值，无此项者按缺省值。结果一旦审核确认后即不能进行修改，只有授权者才可修改，并且修改会自动写入日志系统。
 
7）报告发布模块：实现多种报告发布模式：短信发布、E-mail发布、网站发布、语音播报发布、液晶屏显示发布，并能自动向相关科室通过网络发送常规、急诊检验报告，自动将异常检验结果通过网络发回申请科室工作站。
 
8）质量控制模块：实现自动接收仪器的质控结果、自动绘制质控图、根据预先设置的失控规则判断质控结果、标示结果失控或在控状态并打印输出、失控自动提示等。可对标本的进行时效管理，所有需要控制的时间点一目了然。
 
9）查询统计模块：实现按住院号、姓名、性别、年龄、科别、病区、病房、病床、检验医师、项目等条件进行单个或组合查询，可按单项、多项条件组合复杂查询并将病人的历史结果形成曲线图以方便临床分析。
 
10）微生物模块：实现细菌库、抗生素库、分类、分组、对照管理，仪器数据的自动采集或手工结果处理。可实现细菌有关的各种统计图表。
 
11）试剂管理模块：实现试剂的入库登记、出库登记、报损、停用、在用试剂等统计清单，还可根据试验次数估算试剂的消耗量。